Formation : Analyse RNAseq sous Galaxy, 23 & 24 mai 2017

Lieu : Station Biologique de Roscoff (29)

Objectif général  : connaître les principales méthodes et les principaux outils d’analyse de données RNAseq de novo ou avec génomes de référence.

Objectifs opérationnels : utiliser les outils d’analyse de données RNASeq dans l’environnement Galaxy :

  • Évaluer la qualité du jeu de données brutes,

  • mettre en place des stratégies de nettoyage du jeu de  données,

  • assembler un jeu de données de novo et/ou remapper les jeux de données sur un génomes / transcriptome de référence,

  • annoter un transcriptome,

  • identifier les gènes différentiellement exprimés.

Public visé : Chercheurs, ingénieurs et techniciens, bioinformaticiens ou biologistes ayant des besoins en analyse de données d’expression/transcriptomique de type RNAseq
Prérequis : connaissance de l’environnement Galaxy, expérience en traitement de séquences.